RNA酶
RNA酶，是一種將RNA水解成小分子核苷酸的核糖核酸酶。不同的RNase其專一性不同，因此作用的底物及切割位點(diǎn)也不一樣。今天遠(yuǎn)慕生物就給大家扒一扒各種特色RNA酶的作用及應(yīng)用場景。
RNase R
RNase R是一種Mg2+依賴性的3’→5’核糖核酸外切酶，基本能消化所有線性RNA，但不消化套索或環(huán)狀RNA，或者短于7個核苷酸的具有3’突出端的雙鏈RNA。即是除了tRNAs，5S RNA和內(nèi)含子套索外，大多數(shù)細(xì)胞RNAs都將被RNase R完quan消化。
應(yīng)用：circRNA富集、cDNA文庫的內(nèi)含子篩選。
RNase H
RNase H是指核糖核酸酶H，是一種核糖核酸內(nèi)切酶，可以特異性地水解DNA-RNA雜合鏈中的RNA。RNase H不能水解單鏈或雙鏈DNA或RNA中的磷酸二酯鍵，即不能消化單鏈或雙鏈DNA或RNA。
應(yīng)用：
● 在cDNA第二鏈合成前去除mRNA
● DNA-RNA雜交體的鑒定
● 在Oligo(dT)存在下去除mRNA 的poly(A)尾
RNase A
核糖核酸酶A (RNase A) 是一種核糖核酸內(nèi)切酶，在嘧啶殘基的3’末端切割單鏈RNA，形成具有3’-末端嘧啶-3’-磷酸酯的寡核糖核苷酸。通過RNase A切割相鄰的嘧啶核苷酸，嘧啶-3’-單磷酸也被釋放。含有嘧啶-2’-氟-dNMP修飾的RNA，如通過DuraScribe? T7 Transcription Kits（Cat#DS010925）試劑盒體外轉(zhuǎn)錄形成的DuraScript? RNA，能夠完quan抵抗RNase A的切割。
應(yīng)用：可以用來去除DNA制品中的污染RNA，如基因組DNA/質(zhì)粒提取。
RNase I
RNase I通過分裂每個磷酸二酯鍵，優(yōu)先將單鏈RNA降解為單個核苷3’單磷酸。相比之下，其他核糖核酸酶只在特定的殘基之后才裂解(例如，RNase A裂解3’到嘧啶殘基)，而RNase I沒有堿基偏好性。另外，RNase I具有熱不穩(wěn)定性，在70°C加熱15min后很容易失活。
應(yīng)用：
● 從DNA制備物中去除RNA；
● 核糖核酸酶保護(hù)試驗(yàn)(RPA)中分析和定量RNA；
● 檢測RNA：RNA和RNA：DNA雜交體中的單堿基錯配。
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